Suggerimenti per il rilevamento COVID-19

Per supportare il rilevamento del nuovo coronavirus (COVID-19) e la ricerca e lo sviluppo di vaccini, i Centri statunitensi per il controllo e la prevenzione delle malattie (CDC) e il governo cinese hanno completato il sequenziamento del nuovo genoma del coronavirus e hanno presentato i risultati all'NCBI statunitense GenBank ® database]. Di recente, IDT ha ricevuto richieste da ricercatori di tutto il mondo sul nuovo kit di rilevamento del coronavirus. Di seguito è una breve descrizione.

Centri statunitensi per il controllo e la prevenzione delle malattie

Kit di test per centri di controllo e prevenzione delle malattie negli Stati Uniti * Prende di mira diversi siti sul gene della proteina nucleocapsidica COVID-19 (gene N). Le tre serie di primer / sonde in questo kit devono essere eseguite contemporaneamente al controllo interno mirando al gene RNase P umano. È necessario un totale di 4 test qPCR per ciascun campione di paziente.

1. Il kit di rilevazione utilizza una reazione qPCR in una fase (ovvero, la trascrizione inversa e le successive reazioni qPCR sono completate nella stessa fase);

2. Tutti i 3 test del gene N possono essere considerati come un risultato positivo solo quando Cq 0010010 lt; 35;

3. La reazione di controllo interno di RNase P è la chiave. Cq 0010010 gt; 3 5 significa che l'estrazione del campione non è buona e l'esperimento deve essere ripetuto;

Per i documenti pertinenti e i protocolli sperimentali, consultare gli ultimi Centri statunitensi per il controllo e la prevenzione delle malattie COVID-19 RT-PCR Test Laboratory Laboratory Guide.

Confronto con altri kit di test

Organizzazione mondiale della sanità (OMS)

Il programma sperimentale dell'Organizzazione mondiale della sanità è diverso dal programma sperimentale Centers for Disease Control and Prevention degli Stati Uniti. L'Organizzazione Mondiale della Sanità raccomanda tre reazioni qPCR per confermare se COVID-19 è infetto. Sebbene si tratti di un set completo di protocolli sperimentali, non esiste un metodo di test US CDC più veloce perché richiede tre test consecutivi e un risultato positivo deve essere osservato prima del test successivo. Il protocollo sperimentale viene testato nel seguente ordine:

1. E-gene del coronavirus

2. Gene RdRP: targeting per coronavirus SARS e altri coronavirus associati a pipistrelli

3. Gene RdRP: targeting COVID-19

Centro cinese per il controllo e la prevenzione delle malattie

Il kit di rilevamento del Centro cinese per il controllo e la prevenzione delle malattie raccomanda l'uso di 2 set di primer / sonde. Il gruppo 1 prende di mira ORF 1 ab e il gruppo 2 viene utilizzato per confermare il gene N di COVID-19.

Gruppo di controllo

L'analisi preliminare di simulazione elettronica mostra che la combinazione del modello di controllo positivo IDT N-gene ** e del kit di test CDC degli Stati Uniti è simile all'uso di set di primer / sonde del CDC cinese, del Ministero della salute tailandese e di HKU I risultati ottenuti dall'esperimento sono coerenti. Naturalmente, questo si basa sulla ricerca di simulazione elettronica e si raccomanda agli utenti di verificare il kit selezionato nel proprio laboratorio.

Per ulteriori informazioni, visitare www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents